Орфографический словарь Лопатина
НИИ́, нескл., м. (сокр.: научно-исследовательский институт)
Орфографический словарь Лопатина
НИИ... - часть сложносокращенных слов, пишется слитно, напр.: НИИнефтега́з, НИИхимпро́м, НИИтеплоприбо́р, ГипроНИИполигра́ф, ГипродорНИИ́
Большой русско-украинский словарь
аббревиатура Научно-исследовательский институтНДІ
Русско-голландский словарь
m
( afk. v. нау́чно-иссле́довательский институ́т) researchinstituut het , (wetenscháppelijk) onderzoeksinstituut het